您的位置:首頁(yè) > 技術(shù)文章 > 人肝內(nèi)膽管癌細(xì)胞STR鑒定標(biāo)準(zhǔn)操作流程與結(jié)果解讀指南
技術(shù)文章
一、標(biāo)準(zhǔn)操作流程
樣本準(zhǔn)備:從人肝內(nèi)膽管癌細(xì)胞系中提取基因組DNA,確保樣本具有代表性且細(xì)胞數(shù)量充足。DNA提取可使用商用試劑盒或傳統(tǒng)有機(jī)溶劑法,提取后需檢測(cè)DNA濃度和純度,以滿足后續(xù)檢測(cè)要求。
STR位點(diǎn)擴(kuò)增:選取人類基因組中高度多態(tài)性的13-24個(gè)STR位點(diǎn),如TH01、TPOX、vWA等,使用特異性引物和PCR技術(shù)擴(kuò)增這些位點(diǎn)。引物通常標(biāo)記熒光,便于后續(xù)檢測(cè)。
電泳分離與檢測(cè):將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行毛細(xì)管電泳分離,利用熒光檢測(cè)系統(tǒng)(如ABI3500遺傳分析儀)檢測(cè)電泳分離后的STR片段長(zhǎng)度,生成電泳圖譜。
數(shù)據(jù)分析:根據(jù)電泳圖譜分析各STR位點(diǎn)的等位基因(片段長(zhǎng)度),生成細(xì)胞系的STR基因型。將獲得的STR基因型與已知細(xì)胞系的STR數(shù)據(jù)庫(kù)(如ATCC、DSMZ等)進(jìn)行比對(duì),確認(rèn)細(xì)胞系身份或檢測(cè)是否存在交叉污染。
二、結(jié)果解讀指南
匹配度判定:若受檢細(xì)胞STR位點(diǎn)的基因分型數(shù)據(jù)與其對(duì)應(yīng)的標(biāo)準(zhǔn)細(xì)胞系匹配度≥80%,則判定為標(biāo)準(zhǔn)細(xì)胞系或其衍生細(xì)胞系;若匹配度在56%-80%之間,需結(jié)合細(xì)胞系形態(tài)、特異性標(biāo)記物等輔助分析進(jìn)行綜合判斷;若匹配度≤56%,則判定與其對(duì)應(yīng)的標(biāo)準(zhǔn)細(xì)胞系不相關(guān)。
多等位基因分析:人源細(xì)胞STR圖譜上,一個(gè)基因位點(diǎn)通常只出現(xiàn)1個(gè)或2個(gè)峰(純合或雜合)。若出現(xiàn)3個(gè)及以上峰,可能提示存在同源物種交叉污染或三倍體等多倍體突變現(xiàn)象。
交叉污染檢測(cè):通過比對(duì)多個(gè)細(xì)胞樣本的STR基因型,可檢測(cè)是否存在細(xì)胞系間的交叉污染。若檢測(cè)到混合樣本中的不同STR基因型,則確認(rèn)存在多種細(xì)胞來源。